Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RdxP26043 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RdxP26043 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RdxP26043 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RdxP26043 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RdxP26043 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RdxP26043 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RdxP26043 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RdxP26043 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RdxP26043 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms