Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms