Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms