Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18527 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18527 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18527 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18527 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18527 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18527 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18527 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms