Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms