Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CatspereP0DP43 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms