Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01810 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01810 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01810 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01810 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01810 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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