Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp1O89090 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp1O89090 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp1O89090 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp1O89090 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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