Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SfnO70456 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SfnO70456 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SfnO70456 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SfnO70456 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SfnO70456 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms