Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbieO54910 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms