Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Slc27a2O35488 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Slc27a2O35488 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Slc27a2O35488 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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