Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccrl2O35457 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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