Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms