Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ArxO35085 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ArxO35085 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ArxO35085 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ArxO35085 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ArxO35085 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ArxO35085 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ArxO35085 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ArxO35085 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ArxO35085 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ArxO35085 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ArxO35085 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ArxO35085 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms