Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms