Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21411J3KMS0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21411J3KMS0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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