Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Urb2E9Q7L1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms