Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Zfp558E9Q1J0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Zfp558E9Q1J0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Zfp558E9Q1J0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Zfp558E9Q1J0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Zfp558E9Q1J0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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