Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms