Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc8E9PWG2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms