Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms