Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms