Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Soga1E1U8D0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms