Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms