Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ube2d4D3YUH6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms