Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms