Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms