Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zscan5bB2RTN3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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