Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trabd2bB1ATG9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trabd2bB1ATG9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trabd2bB1ATG9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Trabd2bB1ATG9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trabd2bB1ATG9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trabd2bB1ATG9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trabd2bB1ATG9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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