Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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H2-M5A7VMS3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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H2-M5A7VMS3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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H2-M5A7VMS3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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H2-M5A7VMS3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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