Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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