Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn3aA2ASI5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms