Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Rtf1A2AQ19 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rtf1A2AQ19 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rtf1A2AQ19 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rtf1A2AQ19 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rtf1A2AQ19 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rtf1A2AQ19 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms