Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms