Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms