Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ror1Q9Z139 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms