Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin2Q9WVE8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms