Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms