Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sorbs3Q9R1Z8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms