Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pcm1Q9R0L6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pcm1Q9R0L6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pcm1Q9R0L6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pcm1Q9R0L6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms