Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trappc2lQ9JME7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms