Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms