Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp1Q9JLK7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cabp1Q9JLK7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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