Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp5Q9JKD3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms