Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl28Q9JIL2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl28Q9JIL2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl28Q9JIL2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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