Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmod3Q9JHJ0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmod3Q9JHJ0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmod3Q9JHJ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmod3Q9JHJ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod3Q9JHJ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmod3Q9JHJ0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmod3Q9JHJ0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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