Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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Rb1cc1Q9ESK9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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Rb1cc1Q9ESK9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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