Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp29Q9ES63 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms