Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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