Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms